Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT4P50991 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT4P50991 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT4P50991 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCT4P50991 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCT4P50991 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT4P50991 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT4P50991 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT4P50991 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms