Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTPAP49638 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTPAP49638 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTPAP49638 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTPAP49638 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTPAP49638 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTPAP49638 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTPAP49638 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTPAP49638 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTPAP49638 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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