Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNBP48739 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms