Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PIP4K2AP48426 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIP4K2AP48426 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms