Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRXP46100 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATRXP46100 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATRXP46100 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms