Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RANGAP1P46060 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RANGAP1P46060 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms