Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP5P45974 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP5P45974 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP5P45974 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP5P45974 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP5P45974 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP5P45974 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP5P45974 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USP5P45974 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP5P45974 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP5P45974 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP5P45974 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP5P45974 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms