Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRATP43155 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRATP43155 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRATP43155 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRATP43155 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms