Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 P2RX6-203ENST00000422210 2009 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 P2RX6-206ENST00000452228 576 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 P2RX6-204ENST00000432930 2150 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 P2RX6-205ENST00000442475 2513 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 P2RX6-207ENST00000469722 1186 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 HJURP-203ENST00000414924 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.46■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 HJURP-208ENST00000453122 634 ntTSL 418.67■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 HJURP-209ENST00000454020 806 ntTSL 513.34□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 214.27□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.835e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.795e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 526.1■■□□□ 1.775e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-208ENST00000481047 775 ntTSL 225.58■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-207ENST00000441869 540 ntTSL 324.81■■□□□ 1.565e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.355e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.315e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.245e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-212ENST00000533952 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.33■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-210ENST00000490240 603 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MDK-211ENST00000533283 498 ntTSL 316.7■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.983e-11■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-11■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt25.81■■□□□ 1.722e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 518.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 PNCK-216ENST00000458354 498 ntTSL 332.09■■■□□ 2.733e-6■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 PNCK-207ENST00000419804 561 ntTSL 420.62■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 PNCK-209ENST00000423545 448 ntTSL 420.16■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 219.21■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 517.87■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.361e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-203ENST00000453385 810 ntTSL 222.83■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.991e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-207ENST00000485333 881 ntTSL 220.89■□□□□ 0.931e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-208ENST00000488610 928 ntTSL 320.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-204ENST00000462948 551 ntTSL 220.25■□□□□ 0.831e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 MRPS2-205ENST00000472852 854 ntTSL 320.25■□□□□ 0.831e-10■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 522.24■■□□□ 1.159e-7■■■■■ 28.1
GTF2F1P35269 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 220.18■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.075e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.825e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.537e-14■■■■■ 28
GTF2F1P35269 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.497e-14■■■■■ 28
GTF2F1P35269 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.377e-14■■■■■ 28
GTF2F1P35269 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.377e-14■■■■■ 28
GTF2F1P35269 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.367e-14■■■■■ 28
GTF2F1P35269 IMPDH1-211ENST00000484496 2422 ntTSL 516.15■□□□□ 0.187e-14■■■■■ 28
GTF2F1P35269 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-203ENST00000426514 1493 ntTSL 1 (best)24.39■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 323.74■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SLC27A5-205ENST00000595851 2003 ntTSL 221.56■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 321.36■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-212ENST00000601704 565 ntTSL 221.11■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-205ENST00000597434 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.73■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 320.5■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-209ENST00000599033 618 ntTSL 320.38■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.04■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 519.92■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 518.73■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 518.54■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-204ENST00000593308 713 ntTSL 317.61■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 AC138969.1-203ENST00000537112 4514 ntTSL 515.38■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 513.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 28
GTF2F1P35269 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 28
GTF2F1P35269 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 28
GTF2F1P35269 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 221.28■■□□□ 11e-12■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.414e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-205ENST00000553980 576 ntTSL 421.88■■□□□ 1.094e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-206ENST00000554478 545 ntTSL 417.94■□□□□ 0.464e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-211ENST00000556174 546 ntTSL 417.38■□□□□ 0.374e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-212ENST00000556944 609 ntTSL 416.31■□□□□ 0.24e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 ZNF219-209ENST00000555697 654 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 SAP130-205ENST00000450957 559 ntTSL 422.71■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 220.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 27.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 321.1 ms