Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA7P31268 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms