Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPIFP30405 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPIFP30405 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPIFP30405 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPIFP30405 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms