Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND2P30279 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND2P30279 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND2P30279 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms