Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA1P29973 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA1P29973 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms