Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD1P29536 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms