Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID4AP29374 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms