Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP1P28562 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms