Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms