Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 RRP6YOR001W 2202 nt3.29□□□□□ -1.88
SPT5P27692 DRS2YAL026C 4068 nt3.29□□□□□ -1.88
SPT5P27692 ECM21YBL101C 3354 nt3.29□□□□□ -1.88
SPT5P27692 TOM1YDR457W 9807 nt3.28□□□□□ -1.88
SPT5P27692 FUN30YAL019W 3396 nt3.28□□□□□ -1.88
SPT5P27692 TFC8YPL007C 1767 nt3.28□□□□□ -1.88
SPT5P27692 MSC6YOR354C 2079 nt3.28□□□□□ -1.88
SPT5P27692 MNE1YOR350C 1992 nt3.28□□□□□ -1.88
SPT5P27692 SET2YJL168C 2202 nt3.28□□□□□ -1.88
SPT5P27692 SMY2YBR172C 2223 nt3.27□□□□□ -1.89
SPT5P27692 EMP24YGL200C 612 nt3.27□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt3.27□□□□□ -1.89
SPT5P27692 MGM1YOR211C 2646 nt3.27□□□□□ -1.89
SPT5P27692 NFT1YKR103W 3657 nt3.27□□□□□ -1.89
SPT5P27692 SLM1YIL105C 2061 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YJL120WYJL120W 324 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 PAU8YAL068C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 PAU18YLL064C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 PAU6YNR076W 363 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 PAU20YOL161C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 CHS2YBR038W 2892 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 INP53YOR109W 3324 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3.26□□□□□ -1.89
SPT5P27692 ESL1YIL151C 3357 nt3.25□□□□□ -1.89
SPT5P27692 FRE2YKL220C 2136 nt3.25□□□□□ -1.89
SPT5P27692 RPS25BYLR333C 327 nt3.25□□□□□ -1.89
SPT5P27692 ESC1YMR219W 4977 nt3.25□□□□□ -1.89
SPT5P27692 SIR3YLR442C 2937 nt3.25□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YOR296WYOR296W 3870 nt3.24□□□□□ -1.89
SPT5P27692 ZRG8YER033C 3231 nt3.24□□□□□ -1.89
SPT5P27692 RPL6AYML073C 531 nt3.24□□□□□ -1.89
SPT5P27692 CDC53YDL132W 2448 nt3.24□□□□□ -1.89
SPT5P27692 INP51YIL002C 2841 nt3.23□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YDL196WYDL196W 330 nt3.23□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YHL005CYHL005C 393 nt3.23□□□□□ -1.89
SPT5P27692 PRP8YHR165C 7242 nt3.23□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YGR067CYGR067C 2415 nt3.23□□□□□ -1.89
SPT5P27692 MDM1YML104C 3384 nt3.23□□□□□ -1.89
SPT5P27692 CBF2YGR140W 2871 nt3.22□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YCR043CYCR043C 384 nt3.22□□□□□ -1.89
SPT5P27692 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt3.22□□□□□ -1.89
SPT5P27692 ACM1YPL267W 630 nt3.21□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt3.21□□□□□ -1.9
SPT5P27692 UTP14YML093W 2700 nt3.21□□□□□ -1.9
SPT5P27692 NCA2YPR155C 1851 nt3.21□□□□□ -1.9
SPT5P27692 PIG1YLR273C 1947 nt3.21□□□□□ -1.9
SPT5P27692 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.2□□□□□ -1.9
SPT5P27692 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.2□□□□□ -1.9
SPT5P27692 BRP1YGL007W 378 nt3.2□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YCL046WYCL046W 324 nt3.2□□□□□ -1.9
SPT5P27692 FLO11YIR019C 4104 nt3.2□□□□□ -1.9
SPT5P27692 PUT3YKL015W 2940 nt3.19□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt3.19□□□□□ -1.9
SPT5P27692 RLM1YPL089C 2031 nt3.19□□□□□ -1.9
SPT5P27692 SSN2YDR443C 4263 nt3.19□□□□□ -1.9
SPT5P27692 HAL9YOL089C 3093 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YLR278CYLR278C 4026 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 PAU3YCR104W 375 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 ATP7YKL016C 525 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 TCB2YNL087W 3537 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 HOS4YIL112W 3252 nt3.18□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YDR544CYDR544C 429 nt3.16□□□□□ -1.9
SPT5P27692 PNC1YGL037C 651 nt3.16□□□□□ -1.9
SPT5P27692 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.16□□□□□ -1.9
SPT5P27692 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.16□□□□□ -1.9
SPT5P27692 FIG4YNL325C 2640 nt3.16□□□□□ -1.9
SPT5P27692 ATG11YPR049C 3537 nt3.15□□□□□ -1.9
SPT5P27692 VTC3YPL019C 2508 nt3.15□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.15□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YOR102WYOR102W 351 nt3.15□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt3.15□□□□□ -1.91
SPT5P27692 SRB8YCR081W 4284 nt3.15□□□□□ -1.91
SPT5P27692 MET6YER091C 2304 nt3.15□□□□□ -1.91
SPT5P27692 TFB5YDR079C-A 219 nt3.14□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YJL022WYJL022W 309 nt3.14□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YMR326CYMR326C 309 nt3.14□□□□□ -1.91
SPT5P27692 RAD34YDR314C 2079 nt3.14□□□□□ -1.91
SPT5P27692 PMR1YGL167C 2853 nt3.14□□□□□ -1.91
SPT5P27692 ZRG17YNR039C 1818 nt3.14□□□□□ -1.91
SPT5P27692 RAX2YLR084C 3663 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 SAP1YER047C 2694 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 NOC3YLR002C 1992 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 NAM7YMR080C 2916 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YME2YMR302C 2553 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 CAT2YML042W 2013 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YIL169CYIL169C 2988 nt3.13□□□□□ -1.91
SPT5P27692 AIM44YPL158C 2277 nt3.12□□□□□ -1.91
SPT5P27692 RPL31AYDL075W 342 nt3.12□□□□□ -1.91
SPT5P27692 ZIP2YGL249W 2115 nt3.12□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt3.12□□□□□ -1.91
SPT5P27692 APL5YPL195W 2799 nt3.12□□□□□ -1.91
SPT5P27692 AMS1YGL156W 3252 nt3.11□□□□□ -1.91
SPT5P27692 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt3.11□□□□□ -1.91
SPT5P27692 RSE1YML049C 4086 nt3.11□□□□□ -1.91
SPT5P27692 SGS1YMR190C 4344 nt3.1□□□□□ -1.91
SPT5P27692 MMS22YLR320W 4365 nt3.1□□□□□ -1.91
SPT5P27692 AHC1YOR023C 1701 nt3.1□□□□□ -1.91
SPT5P27692 HSH155YMR288W 2916 nt3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms