Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B4P23634 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms