Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPREP23469 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPREP23469 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPREP23469 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPREP23469 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms