Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms