Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB8P17481 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB8P17481 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB8P17481 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB8P17481 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB8P17481 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB8P17481 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB8P17481 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB8P17481 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB8P17481 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB8P17481 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB8P17481 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB8P17481 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB8P17481 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms