Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms