Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRF1P14222 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms