Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DOBP13765 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms