Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL5P13501 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL5P13501 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL5P13501 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL5P13501 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL5P13501 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms