Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A1P11836 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms