Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TOP2AP11388 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2AP11388 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms