Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP1P11387 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP1P11387 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1P11387 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1P11387 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms