Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTAP09496 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTAP09496 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTAP09496 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTAP09496 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms