Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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