Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP3P08254 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP3P08254 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP3P08254 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms