Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3DP05423 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms