Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYCNP04198 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYCNP04198 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYCNP04198 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms