Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGHDP01880 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGHDP01880 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHDP01880 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGHDP01880 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGHDP01880 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGHDP01880 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGHDP01880 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGHDP01880 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHDP01880 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHDP01880 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHDP01880 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms