Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3JO75822 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3JO75822 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms