Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP4O75379 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP4O75379 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms