Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA4O75335 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms