Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPSNAP2O75323 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms