Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBNO60934 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBNO60934 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBNO60934 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBNO60934 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBNO60934 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms