Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP104O60308 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP104O60308 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP104O60308 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP104O60308 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms