Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD5O60279 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms