Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP2AO43633 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms