Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTSS1O43312 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTSS1O43312 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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