Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGFO15240 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGFO15240 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGFO15240 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGFO15240 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGFO15240 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGFO15240 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VGFO15240 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGFO15240 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGFO15240 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGFO15240 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGFO15240 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGFO15240 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGFO15240 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGFO15240 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms