Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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CEP290O15078 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP290O15078 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP290O15078 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP290O15078 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP290O15078 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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CEP290O15078 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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CEP290O15078 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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CEP290O15078 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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CEP290O15078 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP290O15078 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP290O15078 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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CEP290O15078 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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CEP290O15078 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP290O15078 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP290O15078 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP290O15078 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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