Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNMO15061 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNMO15061 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNMO15061 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNMO15061 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNMO15061 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNMO15061 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNMO15061 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNMO15061 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNMO15061 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNMO15061 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms