Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A2O14975 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms