Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASKO14936 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASKO14936 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASKO14936 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASKO14936 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASKO14936 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms