Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLRMTO00411 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLRMTO00411 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms